我的小分子库是sdf格式的，但是里边的数据是2D的形式，我要用autodock做dock，需要转成3D的，请教大家 有什么软件可以做这种转换？
corina,这个软件有在线试用:


concord，sybyl软件中的模块，可以申请试用；

ligprep，schrodinger软件中的模块，应该也可以申请试用；

好像molsoft ICM-pro也有相应的转换模块；

呵呵，如果不嫌麻烦，用gassian算也可以。