我分离得到了一个甾醇类化合物,经过H,C,HHCOSY,HMQC,HMBC,MS判断了它的结构,现在我想知道它的几个甲基和羟基是R还是S构型的,我应该怎么办呢
首先,R或S是分子的绝对构型,是按照CIP惯例来命名的,此种命名方式避免了Fischer惯例的局限性,手性碳上相连的四个碳原子,把排列次序最小的放在最远的位置,再看其它三个基的排列,如果由大到小是按顺时针方向,则是R型,如果是反时针方向,则是S型。
单晶X射线衍射法可以独立确定分子的绝对构型。单晶X射线衍射法测定分子的绝对构型包括直接法和间接法。直接法:其测定原理是应用不同化学元素对X射线的反常散射(色散)效应。若待测药物样品仅含有C,H,N,O元素是,应使用CuKα辐射,衍射实验的θ角度不低于57°;若待测样品种含有原子序数大于10的元素时,可以应用MoKα辐射,衍射实验的θ角度不低于25°。
间接法:利用分子结构中部分已知构型的基团确定分子构型。衍射实验采用CuKα或MoKα辐射均可。应该注意的是:由于单晶X射线衍射结构分析的对象仅为待测样品中的一颗晶体,样品缺少普遍性,需要对药物样品进行粉末X射线衍射实验,用单晶结构数据计算该构型手性药物的理论粉末X射线衍射图谱,并与实验粉末X射线衍射图谱比较,当二者一致时即可证明衍射用单晶具有普遍性,从而确定手性药物的构型。
首先,R或S是分子的绝对构型,是按照CIP惯例来命名的,此种命名方式避免了Fischer惯例的局限性,手性碳上相连的四个碳原子,把排列次序最小的放在最远的位置,再看其它三个基的排列,如果由大到小是按顺时针方向,则是R型,如果是反时针方向,则是S型。
单晶X射线衍射法可以独立确定分子的绝对构型。单晶X射线衍射法测定分子的绝对构型包括直接法和间接法。直接法:其测定原理是应用不同化学元素对X射线的反常散射(色散)效应。若待测药物样品仅含有C,H,N,O元素是,应使用CuKα辐射,衍射实验的θ角度不低于57°;若待测样品种含有原子序数大于10的元素时,可以应用MoKα辐射,衍射实验的θ角度不低于25°。
间接法:利用分子结构中部分已知构型的基团确定分子构型。衍射实验采用CuKα或MoKα辐射均可。应该注意的是:由于单晶X射线衍射结构分析的对象仅为待测样品中的一颗晶体,样品缺少普遍性,需要对药物样品进行粉末X射线衍射实验,用单晶结构数据计算该构型手性药物的理论粉末X射线衍射图谱,并与实验粉末X射线衍射图谱比较,当二者一致时即可证明衍射用单晶具有普遍性,从而确定手性药物的构型。