最近在探讨铁卟啉的结构与活性机理，不过在用chembiooffice和hyperchem处理时遇到了问题，是不是chembioOffice的3D模块不认识配位键？？
用chemoffice画图，存为chm格式后用hyperchem打开后，金属带的电荷就消失？？还有hyperchem对图形修改时没有配位键，而把所有的键当成离子键，是不是hyperchem软件中没有配位键的相关参数？？？？？
恳请各路大侠帮忙！！
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相关截图如附件！

在chemoffice的3D中打开，并进行能量最优化时，出现下面错误，
并且在draw模块中的Fe是有四个配位键的，这里只显示三个？？？

再存为chm格式后用hyperchem打开后，Fe上的电子消失，C和N上的atom charge也有正有负，这是怎么回事？

如果用chemOffice的3D模块把图形存储为“gjf”格式，再用guassian03计算，没有报错，只是再计算电荷密度分布时，竟然计算二个多小时没有结果！难道chemoffice和guassian也有不融合的地方？？

恳请帮忙！！在下感激不尽！！
此处的铁并非正真带电，而是formal oxidation charge. 你的结构不能用C的sp3结构。用平面四角的铁就对了。因为铁的dz2, dxz and dyz 是填电子的。dxy and dx2-y2是空的。 而且，你应该从分利用对称性啊。怎么着这个也得是d4h对称性。C and N带电也正常啊，不同软件就会有不同地解释，尤其是在用molecular mechanic的时候，这些带电的数值更是五花八门。不要太当回事。如果用g03加上对称性，几个小时的计算就可以搞定。当然要注意铁的基组，double-zeta是最基础的