看到 "http://zdock.bu.edu/software.php"免费提供给学术用户ZDOCK和RDOCK Software,可是没有学术E-MAIL,谁能够帮忙下载并共享,先了!
two protein docking algorithms, designed to operate in succession: a rigid-body docking program, ZDOCK, and a refinement program, RDOCK. All software, as well as the benchmark are freely available to academic users.
怎么没有人回答阿?自己顶一下!!
ZDOCK和RDOCK insightII里的模块
ZDOCK是用来做蛋白质－蛋白质对接的，对学术用户免费，不过不一定要用edu的信箱，用org的信箱也是可以的。
org的信箱可以从这里申请：

OR


ZDOCK包含ZDOCK和RDOCK，使用ZDOCK进行构象搜索，而使用RDOCK进行优化。ZDOCK包括不同平台，最好能提供你使用什么平台，我好给你上传相应平台的软件。

这两个软件都已经被收入了InsightII 软件包中，虽然还对学术用户免费，而且软件也很好用，具有一定的准确性，有几篇文献发表，但是RDOCK需要Charm力场，这个力场涉及的软件就不是免费的了。

其实，做大分子对接的软件还是很多的，其中有几款确实不错，我建议也尝试一下。
比如HADDOCK，3D-DOCK，Rosetta等。这些算法都不一样，比如3D-DOCK和ZDOCK都是FFT算法，而Rosetta则是monte carlo算法。

北京工业大学的王存新教授课题组曾经参加过这方面的竞赛，还获了奖。他们有一篇综述非常清楚，建议你看看。从这里下载：


另外还有几篇英文综述，也建议你看看，我打了个包，可以从这里下载: